Responsável por ações de vigilância, prevenção e controle de doenças transmissíveis; pela vigilância de fatores de risco para o desenvolvimento de doenças crônicas não transmissíveis; saúde ambiental e do trabalhador; e também pela análise de situação de saúde da população.
Desenvolve trabalho contínuo e sistemático de coleta, consolidação e disseminação de dados sobre eventos relacionados à saúde, visando ao planejamento e à implementação de medidas para a proteção da saúde da população, a prevenção e o controle de riscos, agravos e doenças, bem como para a promoção da saúde.
Divide-se em: epidemiológica, ambiental, sanitária (incluindo o gerenciamento de resíduos dos serviços de saúde próprios do município) e saúde do trabalhador. Integra ainda o Centro de Referência em Saúde do Trabalhador (Cerest /Serra), para 49 municípios da Serra.